Uma década se passou desde os eventos de Lost Planet, e face à EDN III mudou dramaticamente. Terraformação esforços foram bem sucedidos e que o gelo começou a derreter, dando lugar a exuberante selva tropical severo e implacável desertos. Os jogadores vão entrar neste novo ambiente e acompanhar as façanhas de seus próprios piratas da neve personalizada em sua busca para apreender o controle do planeta em mudança.